Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn12Q9ER56 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms