Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne8Q9DC53 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms