Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Csnk1dQ9DC28 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Csnk1dQ9DC28 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Csnk1dQ9DC28 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csnk1dQ9DC28 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Csnk1dQ9DC28 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Csnk1dQ9DC28 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csnk1dQ9DC28 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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