Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cnot8Q9D8X5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cnot8Q9D8X5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot8Q9D8X5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms