Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn9Q9D805 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms