Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Borcs6Q9D6W8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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