Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
4930564D02RikQ9D4S4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms