Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef12Q9D2F1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms