Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D1F3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D1F3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D1F3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D1F3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9D1F3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms