Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syf2Q9D198 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms