Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx7Q9CY18 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms