Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX34

Sugt1, Protein SGT1 homolog, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sugt1Q9CX34 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Sugt1Q9CX34 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Sugt1Q9CX34 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Sugt1Q9CX34 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Sugt1Q9CX34 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Sugt1Q9CX34 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Sugt1Q9CX34 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Sugt1Q9CX34 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Sugt1Q9CX34 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sugt1Q9CX34 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms