Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

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Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tdrd12Q9CWU0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Tdrd12Q9CWU0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Tdrd12Q9CWU0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Tdrd12Q9CWU0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Tdrd12Q9CWU0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Tdrd12Q9CWU0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Tdrd12Q9CWU0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Tdrd12Q9CWU0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Tdrd12Q9CWU0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Tdrd12Q9CWU0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Tdrd12Q9CWU0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms