Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PompQ9CQT5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms