Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmd6Q99JI4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmd6Q99JI4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmd6Q99JI4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmd6Q99JI4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmd6Q99JI4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmd6Q99JI4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms