Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Def8Q99J78 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Def8Q99J78 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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