Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AC098483.1-201ENST00000438623 955 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 BOLL-205ENST00000433157 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PHF12Q96QT6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms