Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP9XQ93008 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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