Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
SptssbQ925E8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms