Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek8Q91ZR4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms