Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Setd3Q91WC0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Setd3Q91WC0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms