Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LTBP4Q8N2S1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP4Q8N2S1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP4Q8N2S1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP4Q8N2S1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP4Q8N2S1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP4Q8N2S1 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP4Q8N2S1 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP4Q8N2S1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP4Q8N2S1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP4Q8N2S1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP4Q8N2S1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP4Q8N2S1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP4Q8N2S1 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP4Q8N2S1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP4Q8N2S1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP4Q8N2S1 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP4Q8N2S1 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP4Q8N2S1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP4Q8N2S1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP4Q8N2S1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LTBP4Q8N2S1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LTBP4Q8N2S1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms