Protein–RNA interactions for Protein: Q8K301

Ddx52, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX52, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx52Q8K301 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ddx52Q8K301 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ddx52Q8K301 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ddx52Q8K301 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ddx52Q8K301 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ddx52Q8K301 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ddx52Q8K301 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ddx52Q8K301 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ddx52Q8K301 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ddx52Q8K301 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ddx52Q8K301 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ddx52Q8K301 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ddx52Q8K301 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ddx52Q8K301 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms