Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc9Q8CDN9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc9Q8CDN9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms