Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE2

Ccin, Calicin, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcinQ8CDE2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcinQ8CDE2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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