Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD60

UPF0583 protein C15orf59 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CD60 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CD60 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CD60 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CD60 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CD60 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CD60 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CD60 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CD60 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CD60 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CD60 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CD60 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CD60 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CD60 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CD60 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CD60 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CD60 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CD60 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CD60 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CD60 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CD60 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CD60 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CD60 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CD60 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CD60 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CD60 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8CD60 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CD60 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CD60 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CD60 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CD60 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CD60 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CD60 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CD60 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CD60 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CD60 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CD60 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CD60 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CD60 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CD60 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CD60 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CD60 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CD60 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CD60 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CD60 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CD60 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CD60 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CD60 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CD60 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CD60 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CD60 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CD60 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CD60 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CD60 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CD60 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CD60 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CD60 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CD60 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8CD60 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q8CD60 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q8CD60 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q8CD60 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q8CD60 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CD60 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CD60 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CD60 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CD60 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CD60 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CD60 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CD60 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CD60 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CD60 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CD60 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CD60 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CD60 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CD60 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CD60 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CD60 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CD60 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CD60 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CD60 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CD60 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CD60 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CD60 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CD60 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CD60 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CD60 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8CD60 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8CD60 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8CD60 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8CD60 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8CD60 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8CD60 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8CD60 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8CD60 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8CD60 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8CD60 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8CD60 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8CD60 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8CD60 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8CD60 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms