Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A430089I19RikQ8C9W1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms