Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sfrp1Q8C4U3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sfrp1Q8C4U3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms