Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZ97

Prdm8, PR domain zinc finger protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm8Q8BZ97 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prdm8Q8BZ97 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm8Q8BZ97 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Prdm8Q8BZ97 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm8Q8BZ97 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm8Q8BZ97 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Prdm8Q8BZ97 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm8Q8BZ97 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Prdm8Q8BZ97 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm8Q8BZ97 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm8Q8BZ97 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm8Q8BZ97 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm8Q8BZ97 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm8Q8BZ97 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Prdm8Q8BZ97 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Prdm8Q8BZ97 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm8Q8BZ97 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm8Q8BZ97 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Prdm8Q8BZ97 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm8Q8BZ97 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm8Q8BZ97 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm8Q8BZ97 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm8Q8BZ97 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm8Q8BZ97 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm8Q8BZ97 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm8Q8BZ97 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm8Q8BZ97 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm8Q8BZ97 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm8Q8BZ97 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm8Q8BZ97 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm8Q8BZ97 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm8Q8BZ97 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm8Q8BZ97 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm8Q8BZ97 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm8Q8BZ97 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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