Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pggt1bQ8BUY9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pggt1bQ8BUY9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pggt1bQ8BUY9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pggt1bQ8BUY9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pggt1bQ8BUY9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pggt1bQ8BUY9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pggt1bQ8BUY9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pggt1bQ8BUY9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pggt1bQ8BUY9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pggt1bQ8BUY9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pggt1bQ8BUY9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pggt1bQ8BUY9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pggt1bQ8BUY9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pggt1bQ8BUY9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pggt1bQ8BUY9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pggt1bQ8BUY9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Pggt1bQ8BUY9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pggt1bQ8BUY9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pggt1bQ8BUY9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pggt1bQ8BUY9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pggt1bQ8BUY9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pggt1bQ8BUY9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pggt1bQ8BUY9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pggt1bQ8BUY9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Pggt1bQ8BUY9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pggt1bQ8BUY9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pggt1bQ8BUY9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pggt1bQ8BUY9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pggt1bQ8BUY9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pggt1bQ8BUY9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pggt1bQ8BUY9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms