Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem260Q8BMD6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms