Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cpped1Q8BFS6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpped1Q8BFS6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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