Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NanogQ80Z64 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NanogQ80Z64 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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