Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR3

Skida1, SKI/DACH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skida1Q80YR3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Mdga2-212ENSMUST00000222987 1388 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Gm18547-201ENSMUST00000192439 811 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Skida1Q80YR3 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms