Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ckap2lQ7TS74 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ckap2lQ7TS74 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms