Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssxb3Q6XAS4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssxb3Q6XAS4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssxb3Q6XAS4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssxb3Q6XAS4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb3Q6XAS4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb3Q6XAS4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb3Q6XAS4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb3Q6XAS4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb3Q6XAS4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb3Q6XAS4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb3Q6XAS4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb3Q6XAS4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb3Q6XAS4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb3Q6XAS4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb3Q6XAS4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ssxb3Q6XAS4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb3Q6XAS4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb3Q6XAS4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb3Q6XAS4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb3Q6XAS4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb3Q6XAS4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb3Q6XAS4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ssxb3Q6XAS4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ssxb3Q6XAS4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ssxb3Q6XAS4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ssxb3Q6XAS4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ssxb3Q6XAS4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ssxb3Q6XAS4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ssxb3Q6XAS4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ssxb3Q6XAS4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ssxb3Q6XAS4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ssxb3Q6XAS4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb3Q6XAS4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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