Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssx9Q6XAS3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssx9Q6XAS3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssx9Q6XAS3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssx9Q6XAS3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssx9Q6XAS3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ssx9Q6XAS3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssx9Q6XAS3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ssx9Q6XAS3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssx9Q6XAS3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ssx9Q6XAS3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssx9Q6XAS3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ssx9Q6XAS3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ssx9Q6XAS3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssx9Q6XAS3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ssx9Q6XAS3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssx9Q6XAS3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ssx9Q6XAS3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssx9Q6XAS3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ssx9Q6XAS3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ssx9Q6XAS3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ssx9Q6XAS3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ssx9Q6XAS3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ssx9Q6XAS3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ssx9Q6XAS3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx9Q6XAS3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms