Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp8b3Q6UQ17 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms