Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trak1Q6PD31 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trak1Q6PD31 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms