Protein–RNA interactions for Protein: Q6IR41

C1qtnf6, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf6Q6IR41 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1qtnf6Q6IR41 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms