Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pan3Q640Q5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms