Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc18Q640L5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc18Q640L5 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
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