Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga3Q62470 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms