Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vat1Q62465 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vat1Q62465 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vat1Q62465 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vat1Q62465 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vat1Q62465 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Vat1Q62465 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vat1Q62465 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vat1Q62465 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vat1Q62465 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vat1Q62465 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vat1Q62465 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vat1Q62465 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Vat1Q62465 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Vat1Q62465 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Vat1Q62465 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Vat1Q62465 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vat1Q62465 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vat1Q62465 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vat1Q62465 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Vat1Q62465 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Vat1Q62465 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vat1Q62465 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Vat1Q62465 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Vat1Q62465 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Vat1Q62465 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vat1Q62465 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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