Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Hoxa13Q62424 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Hoxa13Q62424 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Hoxa13Q62424 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Hoxa13Q62424 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Hoxa13Q62424 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Hoxa13Q62424 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Hoxa13Q62424 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Hoxa13Q62424 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Hoxa13Q62424 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Hoxa13Q62424 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa13Q62424 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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