Protein–RNA interactions for Protein: Q62029

Pabpc2, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc2Q62029 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Pabpc2Q62029 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pabpc2Q62029 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms