Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrxQ61687 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrxQ61687 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrxQ61687 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrxQ61687 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrxQ61687 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrxQ61687 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrxQ61687 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrxQ61687 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrxQ61687 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrxQ61687 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrxQ61687 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrxQ61687 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrxQ61687 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrxQ61687 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrxQ61687 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrxQ61687 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrxQ61687 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrxQ61687 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrxQ61687 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrxQ61687 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrxQ61687 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrxQ61687 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrxQ61687 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrxQ61687 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrxQ61687 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrxQ61687 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrxQ61687 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrxQ61687 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrxQ61687 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrxQ61687 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrxQ61687 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AtrxQ61687 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AtrxQ61687 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms