Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Abcd2Q61285 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Abcd2Q61285 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd2Q61285 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcd2Q61285 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms