Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsr1Q5SWD9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms