Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scarf1Q5ND28 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms